Independiente participó de la Copa Argentina 2025, certamen donde llegó a los 8vos de final y fue eliminado por Belgrano, el semifinalista del torneo.

Su camino comenzó en marzo cuando enfrentó a Sportivo Belgrano por los 32avos de final, en San Nicolás. Fue victoria 2-0 para el equipo de Julio Vaccari con goles de Diego Tarzia y Federico Mancuello.

En 16avos chocó con Gimnasia de Mendoza, en San Luis, y el pase lo selló el Rey de Copas por 2-1, con goles de Santiago Montiel y Álvaro Angulo. El gol que abrió el encuentro para los mendocinos fue obra de Diego Mondino.

Finalmente, en 8vos de final, cayó ante Belgrano 2-0, con goles de Franco Jara y Lucas Zelarayán, en un partido para el olvido. El Rojo fue un equipo débil, inofensivo y sin actitud. Muy floja despedida e Independiente terminó siendo eliminado.

Una competencia en donde nunca pudo hacer pie que se volvió a jugar. Habrá que ver cómo le va en el 2026.