Independiente disputó en el primer semestre del año el Torneo Apertura 2025. El rendimiento fue bueno, clasificó como tercero de la Zona B, pero perdió en semifinales con Huracán.
Terminó en la tercera posición con 29 puntos por 8 victorias, 5 empates y 3 derrotas, con 23 goles a favor y 12 en contra. Quedó a 11 unidades de Instituto, último clasificado a playoffs, y a 6 de Rosario Central, líder de la Zona B. Gabriel Ávalos fue el goleador del Rey de Copas con 8 tantos, mientras que Rodrigo Rey tuvo 7 vallas invictas.
Con Julio Vaccari como DT el equipo mejoró notablemente, se revalorizó el plantel y se convirtió en un equipo competitivo. Comenzó el campeonato con caras nuevas: Pablo Galdames, Luciano Cabral, Nicolás Freire, Sebastián Valdéz, Rodrigo Fernández Cedrés, Álvaro Angulo y Joaquín Blazquez.
Arrancó con 3 victorias contundentes; 2 de local y 1 de visitante, ante Sarmiento (2-1), Gimnasia de La Plata (2-0) y Talleres (3-2), pero quién cortó la racha fue River de local, con el 2-0 al Rojo.
Tuvo un juego vistoso y actuaciones destacadas, como en los triunfos frente a Vélez (3-0) y Godoy Cruz (4-0). A su vez, empató el clásico contra Racing 1-1 en casa.
Uno de los partidos más trascendentes fue la fecha 9 con San Lorenzo. El Rey de Copas necesitó la confianza de ganarle a un grande para afianzar y justificar su rendimiento. Con la victoria agónica se quedó con el primer puesto la zona durante varias fechas. Aún con tropiezos como contra Atlético Tucumán (caída 2-0) y Deportivo Riestra (0-0), llegó cómodo a la última jornada para clasificarse entre los tres primeros y avanzar a la siguiente fase.
La ilusión que se generó con el equipo de Vaccari, hizo un gran efecto en el plantel, que dio pelea hasta el final. La muestra de esto se vio en las victorias que le permitieron llegar a la semifinal: eliminó a Independiente Rivadavia por los 8vos de final (1-0), repitió en los 4tos de final con Boca Juniors (1-0). Finalmente, llegó el duro golpe al perder por penales (6-5) frente a Huracán, en el Libertadores de América – Ricardo Enrique Bochini.
